Software científico

Herramientas, métodos y código para investigación reproducible.

El software es una forma de publicar métodos. Esta sección documenta herramientas históricas y servirá como catálogo de repositorios activos, versiones, documentación y ejemplos reproducibles.

HISTÓRICO

Phylemon

Suite web para evolución molecular, filogenética y filogenómica. El proyecto integró herramientas y flujos de análisis en una interfaz accesible.

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HISTÓRICO

PupaSuite

Herramientas para priorizar polimorfismos de nucleótido único con posibles efectos funcionales en estudios de genotipado.

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PRÓXIMAMENTE

Repositorios abiertos

Código, notebooks, datos de ejemplo y documentación de proyectos actuales, con versiones citables y licencias explícitas.

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Criterios de publicación

Los nuevos recursos incluirán, cuando corresponda:

• repositorio y licencia;
• versión estable y registro de cambios;
• datos de prueba o ejemplos mínimos;
• instrucciones reproducibles;
• referencia académica y forma de citar;
• estado de mantenimiento.